补贴发放的进度也各不相同。据该负责人介绍，一些城市直到2006年左右才开始进行货币补贴，“各地情况不同，必然有一个过程，只能一步一步来。”随着房地产市场的快速发展和住房保障政策的调整，货币补贴标准不适应当前形势的情况逐渐凸显。比如许多城市货币补贴“达标线”仍以经济适用房价格为标准。但随着经济适用房供应对象由中低收入家庭收缩为低收入家庭，公务员、教师、企业职工等中等收入家庭不再具备购买经济适用房的条件，只能购买商品房。相对商品房市场的高房价，多数单位现行的补贴标准几乎是杯水车薪，“从近几年各地反馈看，许多地方货币补贴效果越来越差。”上述负责人说。

更突出的矛盾是，条件较好的单位，房改之前职工的住房基本上都达标，基本不需要通过货币补贴解决“遗留问题”，部分单位、特别是一些在地方的中央企业甚至大幅提高补贴标准，住房补贴成了变相福利。而条件不好的单位，职工住房标准低，需要解决的量大，但补贴资金又十分紧张，补贴工作进展缓慢。这一问题在小城镇更为突出。

“尽管23号文要求财政和单位共同出资发放补贴，但实践中，单位承担了主要责任，公共财政对解决老百姓住房问题的支出仍然不够。”上述负责人表示，“目前，在不断加强保障性住房财政投入的同时，也要研究如何通过财政支出，加大对职工购房的支持，使补贴政策起到更好的效果。”